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我校教师在国际著名学术期刊《Molecular Plant》上发表研究论文(图)

来源:生命科学学院 发布日期:2023-04-11

  近日,我校生命科学学院王占旗副教授与中国农科院植保所/浙江大学周雪平教授团队和浙江大学李飞教授团队联合构建了双生病毒-植物-昆虫数据库GPIBase(Geminiviridae-Plant-Insect Database),研究成果“GPIBase: A comprehensive resource for geminivirus–plant–insect research”正式发表于国际著名学术期刊《Molecular Plant》(中科院一区TOP,2021IF = 21.95,2022即时影响因子IF = 26.52)。

  该数据库共包括五大主要模块:

  1)“Browse”:包括双生病毒、病毒宿主、病毒寄主以及病毒伴随卫星β信息的完整搜索与下载,同时详情界面提供了全面的基础与遗传信息;

  2)“Network”:将病毒-植物-昆虫的互作关系通过网络结构进行可视化,直观分析不同病毒、宿主和寄主的关系;

  3)“Phylogeny”:基于双生病毒全基因组序列比对,构建了目前最为全面的双生病毒科的系统发育关系;

  4)“Tools”:提供了BLAST功能进行病毒基因蛋白的比对与搜索;

  5)“Literature”:及时更新双生病毒相关的研究进展,同时通过分析双生病毒文献作者,初步构建了国际双生病毒研究人员社区。该数据库为双生病毒的后续研究提供了便捷和重要基础。

  GPIBase提供了最完整的双生病毒、病毒寄主信息、病毒媒介遗传信息,病毒-植物-昆虫互作信息以及多种在线工具,可实现相关文献同步更新,并初步搭建了国际双生病毒研究人员社区。

  论文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1674205223000400

通讯员:姜露